توجد منظمات دوليّة حكومية لا تنتمي الى منظومة الأمم المتحدة لكنّها ترتبط بعلاقات عمل مع اليونسكو. إنها منظمات تأسست وفقا لاتفاقيات متعددة الأطراف بين حكومات تتصل أهدافها ونشاطاتها بأهداف اليونسكو ونشاطاتها. وعادة ما تكون هذه المنظمات الدولية الحكوميّة متخصصة أو ذات مجال عمل دولي أو إقليمي.  

 وترتبط اليونسكو بهذه المنظمات من خلال ثلاثة أنواع من العلاقات، هي:

• إتفاقات تعاون رسمي

• ترتيبات عمل خاصة   

• علاقات أمر واقع

 تم توقيع إتفاقات تعاون رسمي مع عدد من المنظمات الدوليّة الحكوميّة القادرة على المساهمة السريعة والفعّالة في تحقيق أهداف اليونسكو. ويخضع كل اتفاق لموافقة المجلس التنفيذي ويتّخذ شكل مذكرة أو اتفاقية يوقّعها المدير العام ورئيس المنظمة الدوليّة الحكوميّة المعنيّة. تتضمن جميع المذكرات والاتفاقات والاتفاقيات مواد تشمل:   

• التعاون في مسائل تتصل ببرنامج مشترك في مجالات اختصاص مشتركة، وإنشاء لجان مشتركة لهذا الغرض أو أية آلية إدارية أخرى؛

• استشارات متبادلة بشأن مسائل ذات اهتمام مشترك؛

• تبادل الدعوات والتمثيل وتنظيم اجتماعات يتم فيها مناقشة مسائل ذات اهتمام مشترك؛

• تبادل المعلومات والوثائق.

 وفي غياب الاتفاقات الرسميّة، يمكن التوصل إلى ترتيبات عمل خاصة بين اليونسكو وإحدى المنظمات الدوليّة الحكومية من خلال تبادل رسائل تحدد علاقة العمل التي تربط بينهما فيما يخص معينه محددة طوال فترة زمنيّة محددة. وتشمل هذه الترتيبات شديدة المرونة، حسب الحاجة، جانبا، أو أكثر، من الجوانب المذكورة آنفا.

 وتقيم اليونسكو علاقات أمر واقع مع عدد كبير آخر من المنظمات الدولية الحكوميّة. وغالباً ما تقتصر هذه العلاقات على تبادل المعلومات والوثائق حول مسألة محددة، وفي بعض الحالات، قد تكون الدعوة الى اجتماع ذات اهتمام مشترك.

 وقد وقّعت اليونسكو اتفاقات مع 87 منظمة دولية حكومية لا تنمتي إلى منظومة الأمم المتحدة بهدف تعزيز التعاون مع تلك المنظمات.