UN accord de coopération a été signé le 4 décembre 1996 entre l'IIPE et le Centre for Higher Education Research and Development de l'Université du Manitoba, Canada - un centre qui dispose d'une expérience considérable dans la formation des dirigeants d'université, au Canada et au niveau international.

Elle s'inspirera du projet de l'IIPE sur la gestion institutionnelle dans l'enseignement supérieur qui a débuté en 1989. Le programme de formation conjoints aura pour objet de fournir aux universités un nombre suffisant de dirigeants formés, possédant les attitudes, les compétences et l'expérience nécessaires pour travailler de concert, afin d'améliorer la qualité et l'efficacité des établissements.

LE 7 janvier 1997, l'IIPE a signé un accord de coopération avec le Ministère de l'Enseignement supérieur de Tunisie portant sur un projet de renforcement des capacités de gestion des établissement d'enseignement supérieur. Ce projet, s'étalant sur une période de deux ans et financé par un prêt de la Banque mondiale, prévoit un atelier sous-régional et quatre cours nationaux de formation à l'intention des secrétaires généraux, des chefs d'établissements et d'unités de formation, c'est-à-dire les doyens de facultés, les directeurs d'Instituts supérieurs et les chefs de départements.

Pour la partie pédagogique et scientifique, l'IIPE collabore avec l'Institut supérieur de comptabilité et d'administration des entreprises (ISCAE), une institution tunisienne qui, depuis un an, est chargée d'un programme de D.E.S.S. pour former de futurs responsables de la gestion universitaire en Tunisie. Le but de la collaboration entre l'IIPE et l'ISCAE est de pérenniser le projet de renforcement des capacités par une intégration progressive à l'Institut supérieur de la formation organisée en la matière par l'IIPE.